1、入学考试不同

函授专科需要参加成人高考入学考试，而自考专科没有入学考试。

2、毕业证不同

函授专科毕业证书上面只加盖单章，即毕业学校的章。而自考专科毕业证上面加盖了双章，也就是自考委印章和主考院校印章。

3、学制不同

函授专科学制一般为3年至5年，而自考专科没有学制，什么时候通过课程考试，什么时候申请毕业证。

4、毕业难度不同

函授专科的考试难度更小，更适合学习基度础差、学习时间少的在职人士。而自考专科的考试难度相比其他所有成人考试都要高，仅次于统招高考，想要通过所有考试需考生有一定学习基础和学历能力，更关键的是要有足够的学习时间。